Le parcours permanent proposait jusqu’à présent une approche thématique (l’expérience de l’immigration, la confrontation avec l’Etat et l’opinion publique, les lieux de vie, le travail, la diversité culturelle,…). Il sera en 2022 conçu selon une approche historique centrée sur dix grandes dates, de 1789 à 2015, avec une dernière section consacrée aux questions contemporaines. De nouveaux outils numériques et un parcours réservé aux enfants seront également proposés.
Cette refonte muséographique s’appuie sur le rapport de préfiguration du comité scientifique présidé par l’historien Patrick Boucheron. Elle nécessite au préalable de transformer certains espaces. Il est prévu notamment d’améliorer le parcours de visite pour qu’il devienne circulaire, et ainsi remédier au défaut actuel d’une galerie en cul-de-sac, grâce à l’intégration d’un espace occupé jusqu’à présent par des bureaux administratifs. Les travaux permettront aussi un plus grand renouvellement des œuvres. Les dons, auparavant regroupées dans la Galerie des dons, seront intégrées à l’exposition permanente. La rénovation des espaces s’accompagnera, enfin, de leur sonorisation, permettant la diffusion d’annonces au public, et d’une mise aux normes d’accessibilité.